针对当前上海创新治理中存在的"部门分割、条块分离、要素分散"等问题,进一步推进创新治理体系和治理能力现代化,应以系统思维统领创新治理能力现代化建设的全局,基于创新链、服务链、要素链,明晰政府管理部门的定位和界面,找准政府部门参与创新治理的抓手和载体,积极进行管理、服务要素的组合创新,以实现创新效率的整体提升。