银鲴肝脏转录组测序和功能分析

作者：彭新亮; 刘俊; 赵良杰; 郭旭升^*

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(04): 1471-1477.

DOI：10.13417/j.gab.039.001471

• 银鲴
• 转录组
• 高通量测序

本研究采用二代测序技术对银鲴肝脏组织转录组进行测序和基因功能分析。结果共获得7.55 Gb原始数据,组装后得到70 732条Transcript和43 346条Unigene,平均长度分别为1 173.01 bp和996.83 bp。对Unigene在Nr、GO和KOG数据库分别进行功能注释,分别有25 738 (59.38%)条、17 844 (41.17%)条、16 518(38.11%)条Unigene序列成功注释。经KEGG代谢通路分析可分5大类共175个代谢通路。转录组数据经鉴定共得到4 789个微卫星标记和462 621个单核苷酸多态性标记。上述工作为深入开展银鲴分子标记遗传育种和种质资源保护等研究提供了重要的基础数据。

• 单位
  信阳农林学院