中华按蚊miRNAs的全基因组鉴定和分类

作者：Sana ASGHAR; 陈斌^*

来源：寄生虫与医学昆虫学报, 2019, 26(02): 80-87.

• 中华按蚊
• miRNA
• 鉴定
• 分类
• 拟除虫菊酯抗性

小分子RNA(miRNA)是一类小的非编码RNA,在细胞凋亡、分化和先天性免疫等生物学过程中发挥着重要作用。中华按蚊是中国和东南亚国家分布最广的疟疾传播媒介,本研究采用生物信息学方法注释了中华按蚊基因组的小分子RNA,测序和鉴定了7个样本的小分子RNA。这7个样本来自实验室拟除虫菊酯感性品系、3个野外拟除虫菊酯抗性群体和3个野外拟除虫菊酯感性群体。基于基因组序列共鉴定出272个miRNA,总长为24 978 bp,占基因组的0.009%。从这7个样本的测序和注释中,共鉴定出62个已知的miRNA和432个新的miRNA。这些样本间已知miRNA的数量没有明显的差异,说明这些已知的miRNA非常普通的,表达量最高。在实验室和野外样品之间以及除虫菊酯抗性和感性样品之间,新miRNA的数量没有明显的差异。本研究提供了中华按蚊miRNA的信息框架,然而,还需要进一步的研究来揭示这些样品中miRNA种类之间的关系,以及这些miRNA在不同样品中对拟除虫菊酯抗性的调控机制。

• 单位
  重庆师范大学