稻曲病菌基因组DNA提取方法比较与小文库构建

作者：伏荣桃; 王剑; 陈诚; 龚学书; 卢代华; 罗曦; 郑爱萍

来源：生物技术通报, 2018, 34(04): 102-106.

DOI：10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017-0686

• 稻曲病菌
• CTAB
• SDS
• 基因组小文库

水稻稻曲病是由稻曲病菌引起的真菌病害,现已成为水稻重要的病害之一。旨在寻找一种最佳的稻曲病菌基因组DNA提取方法,并构建基因组小文库。采用CTAB、SDS和真菌DNA试剂盒3种提取方法提取稻曲病菌基因组DNA,并用Illumina系统测序分析,构建基因组小文库。结果显示,CTAB提取法能得到高质量的基因组DNA,小文库测序组装共得29 350288碱基(bp)和17 908 Scaffold,总碱基的GC含量为49.79%。CTAB提取法是稻曲病菌基因组DNA最佳的提取方法,基因组小文库成功的构建为稻曲病菌的基因组gap的填补和致病相关基因的鉴定提供了数据资源。

• 单位
  四川农业大学; 农业部; 四川省农业科学院植物保护研究所