番茄Mi-1基因的SNP分型

作者：李亚玲; 李景富; 康立功; 张贺; 董晓慧; 许向阳

来源：东北农业大学学报, 2010, (10): 36-42.

DOI：10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2010.10.007

• SNP
• 等位基因PCR(AS-PCR)
• 碱基错配
• 分型
• 番茄 single nucleotide polymorphism
• allele specific polymerase chain reaction
• base-mismatch
• genotyping
• tomato

SNP分型是SNP分子标记辅助育种,以及分子遗传作图等研究的重要基础技术。试验利用在番茄Mi-1基因中开发出的一个A/T型SNP位点,应用等位基因聚合酶链式反应技术,成功的对438个F2群体进行了SNP分型。结果表明,这一F2群体中有72个纯合T/T基因型,175个杂合A/T基因型,70个纯合A/A基因型,以及121个不明原因缺失的F2单株,已得基因型经卡方测验符合1:2:1分离比例;同时,试验通过在下游引物3′末端第二、三位点引入错配碱基,以及优化PCR反应体系为Mg2 1.875 mmol.L-1,dNTP 100μmol.L-1,提高了反应的准确性,为番茄抗根结线虫辅助育种打下了基础。

• 单位
  东北农业大学; 黑龙江省农业科学院绥化分院