二倍体和四倍体泥鳅qRT-PCR分析中内参基因优选

作者：罗双双; 高泽霞; 冯兵; 张曼曼; 曹文怡; 周小云^*

来源：华中农业大学学报, 2019, 38(05): 1-8.

DOI：10.13300/j.cnki.hnlkxb.2019.05.001

• 泥鳅
• 二倍体
• 四倍体
• 多倍体鱼类
• 表型变异
• 基因表达变异
• qRT-PCR
• 内参基因
• 稳定表达

为筛选在泥鳅中稳定表达的内参基因,以确保泥鳅基因表达分析结果的可靠性,选取ACTB、TUBA、EF1A、GAPDH、TUBB和18SrRNA 6个常用的内参基因作为候选内参基因,分别用BestKeeper、geNorm、NormFinder、ΔCt和RefFinfer软件分析这6个基因在二倍体和四倍体泥鳅胚胎发育阶段、成鱼组织间以及倍性间表达的稳定性。结果显示,在胚胎发育各阶段,TUBB和TUBA的表达最稳定,可作为胚胎发育阶段qRT-PCR分析的内参基因;其中,TUBB在泥鳅倍性间的表达差异不显著,因此,可作为泥鳅胚胎发育中跨倍性qRT-PCR研究的内参基因。在成鱼各组织中,ACTB和18SrRNA的表达最稳定,可用作组织间qRTPCR分析的内参基因;其中,18SrRNA在倍性间的组织表达差异不显著,因此,可作为泥鳅组织间跨倍性qRTPCR的内参基因。

• 单位
  华中农业大学