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摘要
目的 利用宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术分析肺部感染患者下呼吸道微生物特征,提高临床对于肺部感染患者病原学特征的认识。方法 纳入在2020年8月—2021年10月期间,四川大学华西医院应用mNGS技术检测肺泡灌洗液微生物特征的840例疑似肺部感染患者,回顾性分析所有患者的下呼吸道微生物特征。结果 共纳入840例患者,743例检出微生物阳性,其中细菌感染比例最高,占35.13%(261/743);细菌中鲍曼不动杆菌比例最高,占18.98%(141/743),其次是肺炎链球菌(14.13%、105/743),肺炎克雷伯菌(13.46%、100/743),屎肠球菌(12.11%、90/743)和结核分枝杆菌复合群(11.98%、89/743)。其中平均序列数最高的是鲍曼不动杆菌(2607.48)。另外,也检出了一些特殊的病原体,如检出9例鹦鹉热衣原体。真菌感染主要为白色念珠菌(12.38%、92/743),耶氏肺孢子菌(9.02%、67/743)和烟曲霉(7.40%、55/743),其中耶氏肺孢子菌的平均序列数较高(141.86)。另外,也检出了一些特殊的病原体,如检出1例马尔尼菲篮状菌。病毒感染主要为人类β疱疹病毒5型(17.90%、133/743),人类γ疱疹病毒4型(17.36%、129/743),人类β疱疹病毒7型(16.15%、120/743)和人类α疱疹病毒1型(13.59%、101/743),其中平均序列数最高的是人类α疱疹病毒1型(367.27)。寄生虫感染最少,只检出2例多房棘球绦虫,2例广州管圆线虫,2例屋尘螨和1例粉尘螨,以合并细菌和病毒感染为主。共有407例患者检出混合型感染,其中以病毒和细菌混合型感染最多(22.61%、168/743)。不同季节的微生物分布也存在一定的特征。秋冬季检出频数最多的是细菌(鲍曼不动杆菌),春夏季检出频数最多的是病毒(人类γ疱疹病毒4型)。结论 肺部感染患者的下呼吸道微生物中,革兰阴性菌以鲍曼不动杆菌和肺炎克雷伯菌为主,革兰阳性菌以肺炎链球菌,屎肠球菌和结核分枝杆菌复合群为主;真菌以白色念珠菌,耶氏肺孢子菌和烟曲霉为主;病毒以人类β疱疹病毒5型,人类γ疱疹病毒4型和人类β疱疹病毒7型为主;寄生虫感染很少,无明显特征;合并感染以细菌感染和细菌病毒混合感染为主;秋冬季和春夏季的微生物特征不同;另外,需要注意特殊的致病微生物,例如鹦鹉热衣原体和马尔尼菲篮状菌等。提示临床医生这些特征可以作为肺部感染病因诊断的参考与依据。
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单位四川大学华西医院
