基于QTL-Seq的水稻抗细菌性条斑病QTL定位

作者:韦敏益; 马增凤; 黄大辉; 秦媛媛; 刘驰; 卢颖萍; 罗同平; 李振经; 张月雄; 秦钢
来源:中国水稻科学, 2022, 1-17.

摘要

【目的】发掘水稻抗细菌性条斑病(简称细条病)新基因,丰富抗病基因资源,为水稻抗细条病基因克隆及分子育种提供依据。【方法】以抗病材料广西普通野生稻WP1和感病品种9311及其衍生的F8:9代RILs群体为研究材料,利用QTL-Seq初步定位与细条病抗性相关的区域,之后利用QTL Ici Mapping 4.1进行复合区间作图以验证结果并精细定位。【结果】QTL-Seq分析分别在第4、8、10染色体上鉴定了一个与细条病抗性相关的位点,复合区间作图验证了第4号染色体抗细条病QTL位点qBLS4.1,表型贡献率和LOD值分别为10.65%和5.03,并进一步将qBLS4.1精细定位在5.27 Mb-5.79 Mb之间521 kb的范围内。抗感亲本序列比对分析发现,在41个基因的编码区共有252个非同义突变,其可能与细条病抗性相关。【结论】通过QTL-seq分析结合复合区间作图法可以更快速高效的对水稻QTL进行定位,本研究鉴定了一个抗细条病性QTL新位点qBLS4.1,为水稻抗细条病新基因鉴定与克隆垫定基础和提供参考价值。