摘要

目的 利用生物信息学方法对多囊卵巢综合征(PCOS)患者卵巢颗粒细胞差异表达的miRNA靶基因进行分析,通过构建miRNA-mRNA调控网络,为PCOS潜在发病机制研究提供新思路。方法 选择PCOS患者卵巢颗粒细胞miRNA表达数据集GES84376作为分析对象,并利用Limma分析差异表达miRNA。利用在线分析网站对差异表达的miRNA靶基因进行预测。应用DAVID网站进行生物信息学分析,并利用SRTING网站及Cytoscape软件构建miRNA-mRNA调控网络。结果 共筛选出251个miRNAs,其中3个miRNA显著上调(miR-3188、miR-4433及miR-3135b)。富集通路(KEGG)分析显示,miR-3188、miR-4433及miR-3135b的靶基因在mTOR信号通路、MAPK信号通路及PI3K/Akt信号通路中富集程度最高。通过STRING网站进行蛋白互作分析,其互作程度最高的前10位关键基因分别为:MAPK1、MDM2、FRS2、AGT、IGF1R、HDAC1、AGO1、AKT3、MTOR及CREB1。通过构建miRNA-mRNA调控网络图,结果显示miR-3188、miR-4433及miR-3135b均参与多种靶基因调控并互有联系,且以miR-3188为核心。同时调控网络中以MAPK1、MDM2及FRS2为核心多个miRNA的共同作用。结论 以生物信息学为基础筛选出的miRNA及其相关靶基因可与PCOS的发生发展相关,其具体机制有待于后续的验证及深入探究。

全文