花叶唐竹4种叶色表型qRT-PCR内参基因筛选

作者：陈凌艳; 谢德金; 荣俊冬; 何天友; 郑郁善^*

来源：分子植物育种, 2019, 17(14): 4592-4599.

DOI：10.13271/j.mpb.017.004592

• 花叶唐竹
• 内参基因
• 实时荧光定量
• PCR

本研究结合花叶唐竹(Sinobambusa tootsik f. luteoloalbostriata)不同叶色表型的转录组数据,利用荧光定量PCR技术筛选适合于花叶唐竹叶片的内参基因。参考传统内参基因并结合转录组数据,筛选出7个候选内参基因,分别是Elongation factor 1-alpha (EF1a)、Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH)、Ubiquitin extension protein (UBI)、S-adenosylmethionine decarboxylase (SAM)、TIP41-like family protein (TIP41)、Nucleotide tract-binding protein (NTB)和ABA Hypersensitive 1 (ABH1)。应用qRT-PCR技术对这7个候选内参基因在花叶唐竹4种叶色表型中的表达情况进行检测,并利用BestKeeper、GeNorm以及NormFinder 3种软件计算并分析了7个候选内参基因在花叶唐竹不同叶色表型中的表达稳定性。结果表明:GAPDH、EF1a和SAM 3个基因的表达最为稳定、ABH1的稳定性最差;分别以GAPDH、EF1a和SAM 3个基因为内参,分析了PsbA基因在花叶唐竹4种叶色表型中的相对表达量,结果显示趋势一致,从而验证了GAPDH、EF1a和SAM的表达稳定性,这3个基因均可作为花叶唐竹qRT-PCR技术验证表达量的内参基因。该研究为花叶唐竹叶色表型差异的分子机理研究提供了科学依据。

• 单位
  福建农林大学