芹菜中6-磷酸甘露糖还原酶基因的克隆、进化和表达分析

作者：蒋倩; 王枫; 侯喜林; 马静; 李梦瑶; 熊爱生

来源：南京农业大学学报, 2013, 36(04): 18-24.

• 芹菜
• 6-磷酸甘露糖还原酶
• 基因克隆
• 进化
• 实时定量PCR
• 基因表达

以2个芹菜品种‘津南实芹’和‘美国西芹’为试材,采用RT-PCR技术分别获得6-磷酸甘露糖还原酶(M6PR)cDNA序列。序列分析表明:来源于2个芹菜品种的6-磷酸甘露糖还原酶基因核苷酸序列全长均为930 bp,编码309个氨基酸;预测其蛋白质相对分子质量为35×103,pI值为6.38。空间结构分析显示:M6PR蛋白由11个α-螺旋和13条β-延伸主链组成,中间形成1个疏水穴;催化四分体(Asp、Tyr、Lys和His)分布于疏水穴内部,具有催化活性。进化分析显示:芹菜M6PR与卷柏、小立碗藓、云杉等远古物种的醛-酮还原酶(AKR)相似性较高。实时定量PCR表达分析表明:M6PR基因主要在芹菜的茎中表达,具有明显的组织特异性。

• 单位
  农业部; 作物遗传与种质创新国家重点实验室; 南京农业大学