运用TaqMan探针实时荧光PCR技术检测AKAP10基因2073A/G单核苷酸多态性

作者：王默进; 周总光; 王玲; 李园; 张鹏; 张益; 崔长富; 周斌

来源：四川大学学报（医学版）, 2009, 40(02): 275-278.

DOI：10.3969/j.issn.1672-173X.2009.02.021

• TaqMan探针
• 实时荧光PCR
• 单核苷酸多态性

目的建立一套以TaqMan探针实时荧光PCR技术为基础的单核苷酸多态性(SNP)检测平台,并用于AKAP10基因2073A/G SNP的检测。方法设计一对TaqMan探针加入到PCR反应系统中,并设立阴阳对照,对AKAP10基因2073A/G SNP进行分型。同时验证部分样本PCR产物的直接测序结果。结果运用TaqMan探针实时荧光PCR技术对AKAP10基因2073A/G SNP检测结果准确,与PCR产物的直接测序结果完全一致。AKAP10基因2073A/G多态性分布与性别年龄无关(P>0.05)。非条件logistic回归分析提示,AKAP10基因2073A/G突变型(AG+GG)与野生型AA相比增加结直肠癌的发生风险(OR=1.52,95%CI:1.072.15,P=0.019)。结论通过合理设计TaqMan探针,设立阴阳性对照,应用TaqMan探针实时荧光PCR技术成功建立起一套SNP检测平台。AKAP10基因2073A/G多态性与结直肠癌发病存在显著相关性。

• 单位
  四川大学华西医院