烟草脉带花叶病毒基因组序列分析

作者：蔡联合; 陈媛媛; 谢小东; 魏攀; 张剑锋; 王忠; 李锋; 魏春阳; 王燃; 武明珠; 罗朝鹏; 杨军; 林福呈

来源：中国烟草学报, 2015, 21(06): 113-120.

DOI：10.16472/j.chinatobacco.2015.008

• 烟草脉带花叶病毒
• 保守基序
• 序列分析
• 进化分析
• 重组分析

为了探明烟草脉带花叶病毒危害和流行的机制,使用RT-PCR技术扩增获得TVBMV云南分离物YN9.1基因组全序列,并进行了基因组结构、序列同源性、氨基酸保守基序、系统进化和重组分析。结果表明:(1)YN9.1基因组具有Potyvirus属病毒典型特征,含有在Potyvirus属病毒中较为少见的NIb/CP切割位点Q/N;(2)YN9.1与其它分离物核苷酸序列同源性为90.5-91.1%,氨基酸序列同源性为95.2-96.2%。与YND核苷酸和氨基酸序列同源性最高;(3)对HC-Pro和CP保守基序进行了分析。YN9.1具有RITC、PTK、DAG等病毒蚜虫传播保守基序,其中RITC在Potyvirus属病毒中常见形式为KITC;(4)系统进化树分析结果显示,TVBMV进化形成2个组,云南分离物独立进化形成一组,TVBMV进化与地域具有明显的相关性;(5)重组分析发现PY为ZC1和YN的组内重组体,重组位点位于HC-Pro 3’末端和NIb 5’端。

• 单位
  中原工学院; 中国烟草总公司郑州烟草研究院; 广西中烟工业有限责任公司