利用TCGA数据库分析Calpain-9在结肠癌中的表达及临床意义

作者：田文武; 张先林^*; 卢建明; 杨晓东

来源：武汉大学学报(医学版), 2019, 40(02): 247-250.

DOI：10.14188/j.1671-8852.2018.0743

• 结肠癌
• Calpain-9
• 癌症基因组图谱
• 临床意义

目的:研究Calpain-9在结肠癌中的表达以及临床价值,预测Calpain-9在结肠癌发生发展中的作用。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)下载结肠癌数据集,获得Calpain-9基因表达谱和临床信息。分析Calpain-9在结肠癌中表达的情况,其表达和临床病理学参数的相关性以及对预后的影响。用基因富集化分析的方法预测Calpain-9在结肠癌中调控的通路。结果:在TCGA数据集中,Calpain-9在肿瘤组织中低表达,其表达与组织学类型相关。Calpain-9低表达的患者总体生存期明显低于Calpain-9高表达的患者。Cox多因素分析提示T分期、M分期、Calpain-9表达状态是影响结肠癌患者预后的独立因素。Calpain-9低表达的样本富集到DNA复制、细胞周期等基因集。结论:Calpain-9可以作为抑癌基因在结肠癌中发挥作用,有望成为判断结肠癌预后的指标或者是治疗靶点。

• 单位
  三峡大学仁和医院