基于数据挖掘分析ERO1L在肺腺癌中的表达及临床意义

作者：王晓飞; 赵辉; 张国勇; 廖天竺; 曾大雄; 雷伟; 朱晔涵^*; 黄建安

来源：临床肺科杂志, 2018, 23(12): 2229-2233.

DOI：10.3969/j.issn.1009-6663.2018.12.025

• ERO1L
• 肺腺癌
• TCGA
• cBioPortal
• GEPIA
• 数据分析
• 预后

目的探索内质网氧化还原1样蛋白(endoplasmic reticulum oxidoreductin-1-like protein,ERO1L)在肺腺癌中的表达及意义。方法利用c Bio Portal在线分析癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中586例肺腺癌样本中的RNA-Seq数据,并结合患者的完整生存时间信息,采用KaplanMeier法分析ERO1L变异与肺腺癌患者生存之间的关系。通过基因表达谱动态分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)数据库搜索ERO1L mRNA在正常肺组织与肺腺癌组织表达的情况,分析其在不同TNM分期中的表达情况。用MethHC数据库分析ERO1L基因在肺腺癌中的甲基化水平。String-DB数据库分析与ERO1L相互作用的蛋白。结果在230例肺腺癌样本中有18例发生ERO1L基因变异,变异率为8%。Kaplan-Meier生存曲线分析显示ERO1L变异组总体生存期(overall survival,OS)短于无变异组(P=0. 0268)。肺腺癌组织中ERO1L mRNA表达明显高于正常肺组织(P <0. 05),且其启动子甲基化水平显著减低(P <0. 005)。ERO1LB、ERP29、ERP44、GPX7、GPX8、INS、P4HB、PDIA4、PDIA6、TXNDC5等基因与ERO1L有明显的相互作用。结论通过肿瘤基因数据库信息挖掘表明,ERO1L在肺腺癌组织中呈高表达,且与患者预后不良相关,为深入研究ERO1L在肺腺癌发生发展中的作用提供重要理论依据。

• 单位
  苏州大学附属第一医院