NDC1基因在肝癌中的诊断及预后价值的生物信息学分析

作者：吴嘉旭; 胡明超; 王强; 俞文渊; 许华^*

来源：福建医药杂志, 2023, 45(01): 7-12.

DOI：10.3969/j.issn.1002-2600.2023.01.004

• 肝癌
• NDC1基因
• 预后
• 生物信息学

目的 基于生物信息学的方法研究NDC1基因用于肝癌的诊断及预后评估方面的作用。方法 以TCGA数据库和GTEx为发现数据库，使用软件下载所有肝癌患者以及健康人的level 3 HTSeq-TPM格式的RNA测序结果，绘制箱式图及点图用于统计NDC1基因在肝癌组织及正常组织中的差异化表达情况，并使用GEPIA作为验证数据库进行佐证。绘制受试者曲线来评估NDC1基因用于诊断肝癌的效能。根据NDC1基因表达量的中位数将患者区分为NDC1高表达和低表达两组，研究肝癌患者的临床病理特征以及预后情况和NDC1基因表达的关系。绘制生存曲线，探究NDC1基因的高低表达与LIHC患者的生存情况的关系。结果 肝癌患者的NDC1的表达量为2.16(1.746～2.64),明显大于正常组织中的1.449(1.263～1.644),差异有统计学意义(P<0.05);同样的，在55对配对组织中，NDC1基因在肝癌组织中的表达量3.47(3.028～3.749)也明显高于对应的癌旁正常组织中NDC1的表达量2.426(2.278～2.611),差异有统计学意义(P<0.05)。受试者曲线的结果显示了NDC1用于诊断肝癌有着较高的敏感性[曲线下面积=0.843,95%置信区间为(0.809,0.877)];在针对NDC1基因表达和肝癌患者临床病理特征以及预后的关系研究中发现NDC1高表达的肝癌患者相比NDC1低表达患者有着更晚的T分期(P<0.05)和病理分期(P<0.05);此外，NDC1基因高表达的肝癌患者总体生存期也短于NDC1基因低表达的患者。结论 NDC1基因有潜力成为用于肝癌诊断和预后评估的新型生物学标志物。

• 单位
  南京医科大学; 南京医科大学康达学院