基于生物信息学数据库探讨高迁移率族蛋白B-1影响结直肠癌预后的机制

作者：陈安祺; 原娜; 赵威威; 郝晓慧; 王聪; 卢秀荣; 宋晓; 张志林^*

来源：中国临床研究, 2022, 35(11): 1533-1539.

DOI：10.13429/j.cnki.cjcr.2022.11.010

• 结直肠癌
• 高迁移率族蛋白B-1
• 肠道菌群
• 普罗威登斯菌属

目的 通过生物信息学数据库观察高迁移率族蛋白B-1(HMGB-1)与临床病理特征、肠道菌群的关系，探讨其影响结直肠癌患者预后是否与肠道菌群失衡有关。方法 收集公共基因芯片(GEO)数据库中3个结直肠癌数据集的临床资料，分析其与结直肠癌临床特征及预后的关系。选择河北北方学院附属第一医院2021年5月至11月88例结直肠癌患者，检测其血清标本中HMGB-1的表达，并以最佳截断值为界将标本分为HMGB-1H组和HMGB-1L组，从两组中各选取10例患者粪便进行16S rDNA序列测序。结果 ROC曲线显示，数据库中HMGB-1水平预测结直肠癌预后的曲线下面积(AUC)为0.583,HMGB-1的最佳截断值为10.24 ng/ml。与HMGB-1L相比，HMGB-1H的患者TNM分期较晚，总生存期短，易复发和转移(P<0.05),且高HMGB-1水平及和TNM分期是结直肠癌患者死亡的独立危险因素(P<0.05)。两组患者的16S rDNA测序结果提示HMGB-1H组与HMGB-1L组的菌群组成有一定的相似性；两两比较，在门水平，HMGB-1H组主要以厚壁菌门为主，而HMGB-1L组主要以变形杆菌门为主。在属水平，HMGB-1L发现普罗威登斯菌属富集。Tax4Fun功能预测显示，两者差异菌群的功能富集多集于DNA损伤修复功能，糖酵解、氨基酸代谢等。结论 HMGB-1的升高与结直肠癌的预后差密切相关。HMGB-1的升高可能导致普罗威登斯菌属的减少而影响结直肠癌的预后，机制与结直肠癌的癌细胞DNA损伤修复及其代谢等有关。

• 单位
  河北北方学院; 河北北方学院附属第一医院