东乡野生稻可培养内生细菌群落组成及多样性

作者：陈志远; 刘珺; 杨星鹏; 刘梦; 汪涯; 张志斌^*; 朱笃

来源：生物多样性, 2019, 27(12): 1320-1329.

• 野生稻
• 植物内生菌
• 分类
• 系统发育
• 组成分析

内生细菌对宿主植物生长发育和生理代谢具有重要影响,揭示其群落组成和多样性具有重要的生物学和生态学意义。本研究采用可培养法从东乡野生稻(Oryza rufipogon)不同组织中分离获得94株内生细菌,基于16S rRNA基因序列比对和系统发育分析将其归属于变形菌门、放线菌门和厚壁菌门3门14科17属,其中芽孢杆菌属(Bacillus)和微小菌属(Microbacterium)为优势属,分别占总株数的27.7%和20.2%。不同组织中内生细菌的分布和多样性存在差异,根中内生细菌数量最多(34株,36.2%),叶次之(32株,34.0%),茎最少(28株,29.8%);根中内生细菌Shannon-Wiener多样性指数(H′=2.52)、Simpson优势度指数(D=0.88)和Pielou均匀度指数(E=0.72)均高于茎与叶,根和茎的Jaccard相似性系数(C=0.29)低于根和叶(C=0.47)以及茎和叶(C=0.45)。研究结果表明,东乡野生稻内生细菌具有丰富的物种多样性,并且不同组织部位的内生细菌组成存在差异,根中内生细菌多样性最丰富。

• 单位
  江西省亚热带植物资源保护与利用重点实验室; 江西省生物加工过程重点实验室; 江西师范大学; 生命科学学院; 江西科技师范大学