肉牛肝脏miR-23a的靶基因及生物学功能预测

作者:袁建彬; 胡惠洁; 徐晶; 郭景茹
来源:甘肃畜牧兽医, 2021, 51(02): 50-53.
DOI:10.15979/j.cnki.cn62-1064/s.2021.02.015

摘要

通过探究运输应激肉牛肝脏中miR-23a的表达变化,探究肉牛肝脏miR-23a与应激可能存在的关系,并对其进行生物学功能预测,深入探析miR-23a生物学功能。将10头肉牛随机分为运输0 h组、和运输6 h组,80 km/h的速度进行公路运输刺激。运用高通量测序技术筛选差异表达的肝脏miRNAs,采用生物信息学分析方法对miR-23a进行生物学功能预测。结果表明,与运输0 h组相比,运输应激两组肝脏miR-23a表达量升高。应用Targetscan、miRWalk和miRTarBase三款软件对miR-23a靶基因预测,分别预测到1 238、10 112、427个靶基因。其中,发现HSPA13、MAP3K5、AKT3、IL6R等可能是与应激联系密切的靶基因。结果提示,运输应激肉牛肝脏miR-23a的表达变化能够对细胞生长发育、增殖、分化、和凋亡等方面产生重要影响。

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