藜科植物藜和灰绿藜实时荧光定量PCR内参基因的选择

作者：刘艳霞; 兰欣欣; 曹婧; 张晶华; 兰海燕

来源：广西植物, 2016, 36(12): 1511-1459.

• 藜
• 灰绿藜
• 实时荧光定量PCR
• 内参基因
• 胁迫

选择合适的内参基因是实时荧光定量PCR(qRT-PCR)研究的关键,目前对藜科耐盐(盐生)植物胁迫相关基因的表达分析中所用内参基因的报道较为有限。该研究利用Ge Norm、Norm Finder和Best Keeper 3个内参基因分析软件,对已选择过的β-TUBULIN、β-ACTIN、GAPDH 3个常用候选内参基因进行了比较分析,筛选出在Na Cl和PEG胁迫下藜和灰绿藜中表达相对稳定的内参基因。结果表明:Ge Norm、Norm Finder内参软件分析在Na Cl和PEG胁迫下,GAPDH是藜和灰绿藜中均共同稳定表达的内参基因,同时在藜和灰绿藜中也有各自表达较稳定的内参基因,β-ACTIN在藜中稳定表达,β-TUBULIN则在灰绿藜中稳定表达。对相同科不同种的植物内参基因表达差异进行比较,内参基因在相同科中具有相同稳定表达的内参;对相同胁迫下两种不同植物内参基因表达稳定性进行分析,内参基因的选择需根据实际的实验材料和实验条件而定。基于3个分析软件对以上3个常用内参基因的分析结果,初步确定了在藜科植物藜和灰绿藜中相对稳定的内参基因,为藜和灰绿藜胁迫相关基因的定量表达分析提供了参考依据。