马铃薯V型ATP酶E亚基基因的生物信息学分析

作者：庞鹏湘; 郜刚^*

来源：中国马铃薯, 2020, 34(02): 72-77.

• 马铃薯
• V型ATP酶E亚基
• 生物信息学

V-ATP酶广泛分布于真核细胞和原核细胞中,负责质膜上的质子转运和胞内不同细胞器的酸化,包括吞噬体、早期内小体、溶酶体、突触体、高尔基体、网格蛋白凝聚体、致密核心分泌颗粒和植物液泡。利用生物信息学软件对V型ATP酶E亚基的理化性质、细胞内定位、保守结构及高级结构进行预测。基于NCBI数据库中有物种代表性的20种V型ATP酶E亚基序列构建了进化树。该序列的全长为725 bp,可编码一条241个氨基酸的蛋白质,理论相对分子质量为27 689.84 D,定位于细胞质中,无信号肽序列,无跨膜区,等电点为7.28,属于亲水性氨基酸。相关结果期望为进一步研究该基因在马铃薯中特别是在抗青枯病分子育种中的功能提供相关依据。

• 单位
  山西师范大学; 生命科学学院