摘要
目的 通过生物信息学方法探讨KLHL7基因在胃癌与癌旁组织的差异表达及与胃癌临床病理特征的关系,探索KLHL7基因参与胃癌发生发展的机制。方法 通过仙桃学术在线工具分析研究KLHL7基因在胃癌与癌旁组织间的差异表达及相关病理参数,利用在线工具cBioPortal和Sanger学术平台对与KLHL7具有相关性的共表达基因进行筛选,并开展京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。利用STRING和Cytoscape 3.8对KEGG聚类分析中发现的与肿瘤密切相关的基因进行关键核心基因筛选。结果 KLHL7是胃癌中呈高表达的癌基因,与KLHL7基因具有相关性的共表达基因有2 785个,包括上调2 486个和下调299个,部分基因富集在与肿瘤关系密切的25个信号通路中,包括自噬、凋亡、细胞周期、慢性白血病、子宫内膜癌、肿瘤坏死因子(TNF)、缺氧诱导因子(HIF-1)、结肠癌和Wnt等信号通路。免疫细胞浸润分析发现,高表达的KLHL7与中央记忆型T细胞(Tcm)和辅助性T细胞(Th细胞)浸润呈正相关,与浆细胞样树突状细胞(pDC)和Th17细胞浸润呈负相关。经蛋白互作(PPI)网络分析结合Cytoscape 3.8分析筛选发现,其中获得相关性较强的4个共表达基因BBS10、PPP1CB、ARL13B和MEAF6是影响KLHL7生物学表型的关键核心基因。结论 KLHL7基因是胃癌中潜在的癌基因,与胃癌侵袭转移、细胞免疫浸润和预后有关。共表达相关基因BBS10、PPP1CB、ARL13B和MEAF6是影响KLHL7生物学表型的关键核心基因。
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