高通量测序技术是针对土壤微生物研究的主要生物技术。本文从物种多样性、结构多样性、功能多样性以及遗传多样性等4个方面对目前高通量技术在土壤微生物多样性分析研究中的进展进行阐述,并对其存在的一些问题进行总结和展望。