封闭群比格犬微卫星的筛选及初步应用

作者：蒋辉; 李银银; 李长龙; 郭萌; 李方正; 王冬冬; 杜小燕^*; 陈振文

来源：实验动物科学, 2020, 37(05): 24-30.

DOI：10.3969/j.issn.1006-6179.2020.05.005

• 比格犬
• 微卫星
• 位点
• 遗传性息
• 遗传检测

目的筛选可用于比格犬遗传检测的微卫星位点,并对小型比格犬群体进行了遗传结构分析。方法选取来自文献的微卫星位点120个,包括比格犬位点23个和其他犬类遗传检测的位点97个。用DNA池对这些位点进行PCR条件优化后,挑选扩增效果优良的位点对常用比格犬群体进行荧光标记STR扫描和群体遗传结构分析,依据期望杂合度(He)和香农指数挑选符合要求微卫星位点计算群体遗传参数。结果在候选的120个位点中共有73个位点扩增效果优良,STR扫描后选用49个位点进行遗传分析,结果显示该群体有效等位基因数、期望杂合度、平均杂合度、香农指数、多态性信息含量分别为4.9230、0.7574、0.7375、1.6625、0.7038,证明该群体遗传多态信息丰富,群体遗传多样性高。结论所选49个微卫星位点可用于比格犬遗传检测,这些位点还需用更多群体进行验证和优化。

• 单位
  青岛农业大学; 首都医科大学; 基础医学院