SOCS基因家族在肝细胞癌中的表达及生物信息学分析

作者：卜文超; 曾宪智; 关云茜; 谢思源; 陈世新; 汤挺兵; 曹明国^*

来源：山东第一医科大学(山东省医学科学院)学报, 2022, 43(10): 740-747.

• 肝细胞癌
• SOCS家族
• 生物信息学

目的 基于高通量生物信息学方法系统分析细胞因子信号抑制物（suppressor of cytokine signaling,SOCS）基因家族在肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）发生、发展中的作用机制。方法 使用Oncomine、UNLCAN、cBioPortal、Kaplan-Meier plotter、David等多个在线数据库对SOCS家族分子在肝癌细胞中的表达差异、临床病理特征、生存分析、基因突变、生物学功能方面进行综合分析。String在线数据库用于构建SOCS家族基因的蛋白质-蛋白质相互作用网络。结果 大部分SOCS家族基因在HCC中存在表达差异，SOCS5和SOCS7表达显著上调（P <0.05），而SOCS2、SOCS3、SOCS6、CISH表达下调（P <0.05）。该家族基因SOCS1、SOCS2、SOCS4、SOCS5、SOCS7、SOCS8与预后相关（P <0.05）。SOCSs家族成员在HCC患者中的基因改变形式主要包括扩增、突变和多重基因等类型。在HCC与SOCS家族相关的生物学过程主要富集在Jak-STAT、炎症反应等方面。结论 SOCS基因家族大部分成员在HCC中差异表达，可能是治疗肝细胞癌潜在的新靶点。

• 单位
  丽水学院