冰草SSR-PCR体系优化及验证

作者:于肖夏; 杨东升; 于卓*; 卢倩倩; 吴国芳; 李景伟; 张明飞
来源:草业科学, 2020, 37(09): 1760-1769.

摘要

以蒙古冰草(Agropyron mongolicum var. mongolicum) DNA为模板,利用单因素与正交试验设计相结合的方法,对影响冰草SSR-PCR体系的dNTP浓度、Mg2+浓度、引物浓度、模板DNA浓度和Taq DNA聚合酶用量5个因素进行优化。结果表明,冰草SSR-PCR的最佳体系为:dNTP浓度250μmol·L-1、Mg2+浓度2.25 mmol·L-1、引物浓度0.60μmol·L-1、模板DNA浓度40 ng·μL-1和Taq DNA聚合酶用量0.75 U,其余为ddH2O,反应总体积为20μL。本研究筛选出适于冰草SSR-PCR的最佳反应体系,可提高冰草SSR扩增条带的清晰度和可靠性,这为后续深入开展冰草的遗传作图、重要性状QTL定位及分子标记辅助育种等研究奠定了基础。