基于荧光标记的紫娟茶树转录组EST-SSR标记开发

作者：陈春林; 田易萍; 陈林波^*; 邓少春; 徐丕忠; 李朝云

来源：江苏农业学报, 2018, 34(04): 747-753.

• 茶树
• 转录组
• SSR
• 荧光标记

为开发紫娟茶树转录组EST-SSR标记,基于前期对紫娟茶树芽、第2叶、开面叶、成熟叶转录组高通量测序所得到的242 757条Unigene进行多态性分析与评价,再利用荧光标记PCR技术,规模化开发茶树EST-SSR标记。结果表明:从紫娟茶树转录组中搜索得到46 041条Unigene含有57 976个SSR位点,出现频率为23.88%。EST-SSR类型以一核苷酸、二核苷酸、三核苷酸重复为主,占总SSR的98.54%。设计合成138对荧光SSR引物,采用荧光标记PCR技术对4个差异较大的茶树品种进行引物筛选,其中44对引物得到高质量的EST-SSR标记位点。这些EST-SSR可用于茶树遗传多样性分析、分子育种等。

• 单位
  云南省农业科学院茶叶研究所