黄瓜PIP2;4基因生物信息学及干旱胁迫下的诱导表达分析

作者：陈露倩; 赖梦霞; 柴里昂; 李乐乐; 王璐; 杜长霞; 樊怀福^*; 朱祝军

来源：四川农业大学学报, 2020, 38(05): 538-544.

DOI：10.16036/j.issn.1000-2650.2020.05.005

• 黄瓜
• PIP2
• 4
• 生物信息学
• 干旱
• 表达分析

【目的】探究黄瓜PIP2;4(CsPIP2;4 Gene ID:101215300)在干旱胁迫响应中的可能功能。【方法】以华北型黄瓜‘9930’为试材,基于CsPIP2;4为前期研究筛选出的干旱胁迫下显著差异表达蛋白,克隆CsPIP2;4基因,对其进行生物信息学分析,并利用qRT-PCR检测CsPIP2;4在干旱下的表达。【结果】生物信息学分析显示,CsPIP2;4 CDS序列有852bp,编码283个氨基酸,CsPIP2;4蛋白具有疏水性、无信号肽段、有跨膜结构,是定位在质膜的内在蛋白,以无规则卷曲和α-螺旋结构为主,具有典型的水通道蛋白结构功能域,属于MIP超家族;蛋白质同源比对分析显示,CsPIP2;4与甜瓜PIP2;7的亲缘关系最近。qRT-PCR结果表明CsPIP2;4表达受干旱诱导。【结论】CsPIP2;4可能是参与黄瓜干旱胁迫应答过程重要基因,为后续鉴定其在黄瓜响应干旱中的功能奠定了基础。

• 单位
  浙江农林大学