水曲柳FmPDK1基因克隆及表达模式分析

作者：刘璋; 赵兴堂; 于磊; 詹亚光; 张旭

来源：分子植物育种, 2021, 1-12.

• 水曲柳
• PDK1蛋白激酶
• 基因克隆
• 生物信息分析
• 表达模式分析

3-磷酸肌苷依赖性蛋白激酶1 （PDK1）是一种高度保守的真核细胞激酶，是许多AGC激酶亚家族成员的核心调控因子。通过其对AGC激酶的调控进而控制许多基本细胞过程。本研究克隆获得了水曲柳PDK1的基因序列全长，将其命名为FmPDK1 （已上传至NCBI基因库NCBI序列号: MG356659）。水曲柳FmPDK1全长1 470 bp，编码481个氨基酸；该基因内部有完整的open reading frame （ORF），存在螺旋-环-螺旋结构；亲水性不稳定蛋白；不存在信号肽，具有跨膜能力；亚细胞定位预测该蛋白最可能定位于细胞核内；水曲柳FmPDK1芝麻（Sesamumindicum XP＿011094484.1）亲缘关系最近，同源性为83%；4 ℃低温处理下，FmPDK1的表达量发生显著变化；100 mmol/L NaCl处理下，FmPDK1的表达量也发生了变化但是并不显著，脱落酸（ABA）和赤霉素（GA）以及IAA（生长素）三种激素诱导下，FmPDK1表达量均变化显著。水曲柳FmPDK1对寒冷、盐等非生物胁迫以及激素信号做出了应答，有望为进一步研究水曲柳AGC激酶亚家族成员中PDK1基因的特性及功能奠定基础。

• 单位
  东北林业大学; 生命科学学院