摘要
了解红麻乙酰乳酸合成酶基因(ALS)的基因特征及组织表达特异性,可为培育红麻抗除草剂品种提供理论依据。以水稻OsALS1基因为模板,对红麻基因组进行Blastp,得到4个候选基因(HcALS1, HcALS2, HcALS13和HcALS14)。以红麻优良品种‘福红952’叶片的cDNA为模板,利用PCR扩增ALS基因的CDS序列,采用生物信息学分析方法分析ALS基因的基因结构,同时进行了蛋白的同源进化树分析,并采用实时荧光定量PCR检测ALS基因在红麻不同组织和苯磺隆处理的表达情况。结果表明,ALS基因cDNA全长变化在1 962 bp和1 980 bp之间,编码蛋白含有654到660个氨基酸,均包含PLN02470家族(I1vB超级家族)、硫胺焦磷酸(thiamine pyrophosphate, TPP)家族和多个硫胺焦磷酸(thiamine pyrophosphate, TPP)亚族。通过氨基酸序列同源性分析发现,红麻ALS氨基酸序列与水稻的氨基酸序列相似性较高,达到85.4%。进化树分析表明,红麻ALS基因与棉花ALS基因亲缘关系较近。组织特异性表达特征显示,红麻ALS基因在根中的表达量高于茎、叶中的表达量。苯磺隆处理表达分析显示,在12 h处理时HcALS2和HcALS14表达量最低,且HcALS2和HcALS14基因编码蛋白含有I1vB超级家族结构域,在苯磺隆处理红麻叶片中表达较高,暗示其可作为红麻磺酰脲类除草剂的靶标位点。
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