p53转录调控靶基因GGT6对人结肠癌的影响

作者：柳子朝; 杜文静; 李莉^*

来源：基础医学与临床, 2023, 43(06): 953-959.

DOI：10.16352/j.issn.1001-6325.2023.06.0953

• p53
• 转录调控
• γ-谷氨酰转移酶
• 结肠癌

目的 筛选出p53转录调控靶基因，并利用生物信息学分析该基因在结肠癌(COAD)中的作用。方法 对p53蛋白稳定剂Nutlin处理的结肠癌细胞系HCT116的RNA-seq数据进行基因差异分析及GO、KEGG和GSEA富集分析；在HCT116及HCT8细胞中加入Nutlin稳定或转染siRNA敲降p53的表达，利用实时荧光定量PCR检测候选靶基因的mRNA表达；双荧光素酶报告实验验证p53对靶基因的转录调控；利用TCGA数据库中的结肠癌数据分析靶基因在结肠癌组织中的表达及患者预后情况。结果 Nutlin处理结肠癌细胞系HCT116后细胞周期、DNA复制及染色体分离等生物过程基因表达发生变化，同样p53信号通路也被激活。在HCT116及HCT8细胞中γ-谷氨酰转移酶(GGT6)的mRNA水平与p53蛋白表达呈正相关。双荧光素酶报告实验确定了GGT6是p53转录调控的靶基因。TCGA-COAD数据分析表明GGT6在结肠癌组织中表达高于癌旁组织(P<0.001),且GGT6高表达患者的总体生存时间较GGT6低表达患者更长(P<0.01),推测GGT6是结肠癌的抑癌因素。结论 GGT6是一个p53正调控转录靶基因，在结肠癌中可能是一个抑癌因素。

• 单位
  医学分子生物学国家重点实验室; 基础医学院; 北京协和医学院; 山西医科大学; 中国医学科学院基础医学研究所