牦牛RETN基因遗传多态性与生长性状相关性分析

作者:侯孟典; 王会; 柴志欣; 王吉坤; 姬秋梅; 钟金城*; 信金伟*
来源:基因组学与应用生物学, 2020, 39(10): 4432-4440.
DOI:10.13417/j.gab.039.004432

摘要

本研究旨在研究牦牛RETN基因的遗传多样性,选取麦洼粉嘴牦牛(30头)、麦洼黑嘴牦牛(48头)、斯布牦牛(36头)、类乌齐牦牛(47头)4个牦牛群体共161个个体。对RETN基因3个外显子区域及相邻区域进行扩增;利用DNA池测序与直接测序相结合的方法检测牦牛RETN基因的SNP位点;对SNP位点进行分析,并进一步分析其与生长性状的相关性。结果表明,在RETN基因第1外显子区域发现5个突变位点,即A1966G、G1967A、G1976T、G2021T、G2079C,5个位点间具有强连锁不平衡性;5个突变位点在麦洼牦牛、斯布牦牛中处于Hardy-Weinberg平衡状态(p>0.05),在类乌齐牦牛群体中不符合平衡状态;5个多态位点均为低度多态性(PIC<0.25)。5个位点与生长性状相关性分析发现,AA型个体各生长性状数值均高于AG型个体其中5个突变位点与麦洼牦牛体斜长存在显著相关性(p<0.05)。说明RETN基因有丰富的遗传多态性,初步认定A1966G、G1967A、G1976T、G2021T、G2079C位点可以作为一种遗传标记,为选育优良牦牛品种提供依据。