事业单位作为我国相关部门为了实现公共利益而开展各项公益性活动的组织机构,在现代化经济发展中占据重要位置。而财务收支审计是事业单位经济活动中的重要内容,对事业单位事业发展有着直接影响。本文就结合新财务制度下的事业单位财务收支审计内容,重点分析新财务制度下事业单位财务收支审计存在的问题进行分析,并以此为依据,提出新财务制度下加强事业单位财务收支审计的相关措施。