深海沉积物中产淀粉酶细菌的rep-PCR基因指纹分析

作者：戴世鲲; 郑天凌; 郑伟; 王晓颖

来源：厦门大学学报(自然科学版), 2005, S1: 171-174.

• 深海
• 淀粉酶
• ERICPCR
• BOX-PCR deep-sea
• amylase
• ERIC-PCR
• BOX-PCR

利用淀粉酶筛选培养基平板从27个深海沉积物样品中筛选得到30个具有胞外淀粉酶活性的菌株.其中革兰氏阴性细菌有22株,阳性细菌有8株.对这些细菌的基因组DNA进行ERICPCR和BOXPCR扩增,指纹图谱显示大部分菌株均存在数目不等的各自独特的带型,各特异性扩增的主带型能重复稳定出现.比较两种引物的指纹图谱,显示ERICPCR比BOXPCR具有较丰富的图谱多态性.对产生的指纹图谱进行聚类学分析,30株细菌可分为10组,其中5株细菌分别独立成组,最多的第Ⅱ组包含有8株细菌,而在同一聚类组内的细菌可能是处于进化上亲缘关系较近的位置.研究显示,30株菌具有丰富的种属多样性,揭示了深海微生物资源的丰富和...

• 单位
  厦门大学; 生命科学学院; 近海海洋环境科学国家重点实验室