前胃泌素释放肽ProGRP生物信息学分析及抗原决定簇预测

作者：郭玉凤; 张婷; 张超; 薛振伟; 孔晓娜; 周小林^*

来源：中国免疫学杂志, 2021, 37(23): 2827-2831.

• ProGRP
• 生物信息学分析
• 理化性质
• 结构
• 抗原决定簇

目的:分析预测前胃泌素释放肽(ProGRP)蛋白结构及其抗原决定簇,为抗ProGRP单克隆抗体的筛选及其相应的抗原结合位点的确定提供可靠依据。方法:从NCBI网站获取ProGRP不同亚型的氨基酸序列进行比对分析(Clustalw),运用不同生物信息学软件分析蛋白理化性质(Protparam),跨膜区(TMHMM),二级结构、亲水性、表面可及性、柔韧性和抗原指数(DNAstar Protean),三级结构(Swiss Model)以及抗原决定簇(BepiPred-2.0及ABCpred)。结果:ProGRP具有3个同型异构体,属于亲水性蛋白,半衰期为30 h,无跨膜区;ProGRP氨基酸序列中含丰富的二级结构,包括α螺旋、β折叠、β转角和无规则卷曲;ProGRP具有5个潜在的抗原决定簇。结论:该研究筛选的抗原决定簇具有较高的准确性,为鉴定ProGRP单克隆抗体结合位点以及小细胞肺癌(SCLC)的诊治奠定了良好的基础。

• 单位
  中国辐射防护研究院