RUNX3基因在急性髓系白血病中的表达及预后意义

作者:杨小燕; 李鹏; 吴西军; 吴昌学; 庹媛媛; 李燕; 杨红兰; 潘海新; 何志旭*
来源:现代生物医学进展, 2020, 20(02): 313-323.
DOI:10.13241/j.cnki.pmb.2020.02.023

摘要

目的:探讨RUNX3 (Runx transcription factors-3)在急性髓系白血病中的表达及临床预后意义。方法:利用GEPIA和UALCAN数据库分析RUNX3在急性髓系白血病以及各亚型中m RNA表达情况。对癌症基因组图谱(The cancer genomeatlas,TCGA)公共数据集中AML RNA-Seq数据采用Kaplan-Meier Plotter法对AML患者总生存期进行分析。利用UALCAN和String数据库对RUNX3相关基因及其蛋白互作网络和参与的生物学过程进行分析。结果:与正常外周血样本相比,RUNX3在急性髓系白血病患者外周血样本中高表达。在AML各亚型中,RUNX3在M0和M6中表达最高,在M4和M5中表达最低。RUNX3高表达的患者总生存期短(P=0.038)。此外,本研究发现,与RUNX3主要相互作用的蛋白是NOTCH1(P=0, R=0.62),PRF1(P=0, R=0.6),GZMB(P=1.7e-06, R=0.46)。主要参与的生物学过程有细胞黏附、小GTP酶介导的信号转导通路以及造血生成过程(P=0.0202)等。结论:RUNX3在AML中高表达,且在各亚型中表达水平存在差异。RUNX3高表达的AML患者预后较差。该研究为深入研究RUNX3在AML发生发展中的作用提供重要理论依据。