m6A甲基化调节因子影响口腔鳞状细胞癌生存预后的生物信息学分析

作者：徐莉; 余程; 杜习金

来源：华中科技大学学报(医学版), 2020, 49(04): 443-449.

• 口腔鳞状细胞癌
• 生物信息学
• 6A甲基化调节因子" name="keyword">m6A甲基化调节因子
• 预后

目的分析m6A甲基化调节因子对口腔鳞状细胞癌(OSCC)生存预后的影响,探寻相关信号通路和预后相关基因,为OSCC的治疗与预后评估提供候选靶点。方法下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库中OSCC的数据,提取m6A相关基因的表达。使用R软件分析m6A甲基化调节因子基因间的相关性、对m6A甲基化调节因子的基因进行样品聚类分析,并对聚类分组的患者做生存分析和差异性比较。然后,对聚类分组的样本进行基因集富集分析(GSEA)。最后,筛选出m6A甲基化调节因子中OSCC的预后相关基因。结果 OSCC样本分成cluster1和cluster2两组,cluster1的生存期显著低于cluster2,其肿瘤级别显著高于cluster2(均P<0.05)。m6A甲基化调节因子基因间具有相关性。单因素Cox分析发现YTH结构域结合蛋白2(YTHDF2)、异质核糖蛋白C(HNRNPC)和甲基转移酶样因子14(METTL14)是预后相关基因。GSEA分析显示,m6A甲基化调节因子的基因主要涉及肿瘤发生与恶化相关的生物学功能和通路。结论 m6A甲基化调节因子对OSCC生存预后产生影响并反映其恶性程度,其中YTHDF2、HNRNPC和METTL14是预后相关基因,可以作为OSCC治疗和预后评估的候选分子靶点。

• 单位
  华中科技大学同济医学院附属同济医院