江苏省2013—2014年3株柯萨奇病毒B组5型流行株全基因组序列分析

作者：卞莲莲; 姚昕; 高帆; 孙世洋; 毛群颖; 杨晓明^*; 梁争论^*

来源：微生物学免疫学进展, 2019, 47(02): 9-16.

DOI：10.13309/j.cnki.pmi.2019.02.002

• 柯萨奇病毒B组5型
• 基因组
• 重组
• 分析

目的分析引起江苏省疱疹性咽峡炎的柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5, CV-B5)毒株基因组特征。方法对江苏省2013—2014年3例疱疹性咽峡炎患儿临床标本进行病原分离,获得3株CV-B5毒株,进行全基因组序列测定,与GenBank中世界各地不同年份CV-B5流行株序列进行比对分析,使用Mega 5.2软件构建系统进化树,并应用Simplot软件进行重组分析。结果获得3株CV-B5毒株,分别命名为417/JS/CHN/2013、492/JS/CHN/2013和759/JS/CHN/2014,均属于GI.D3亚型,且在位点5 224～5 696 bp(以Faulkner为参考株)与2008年北京市的CV-B3流行株(GQ141875)发生重组,在位点5 696 bp之后与2009年昆明市的CV-B3流行株(JX843810)发生重组。结论 CV-B5在婴幼儿人群中的感染可能存在严重危害,应加强对CV-B5的分子流行病学研究,监测可能发生的重组。

• 单位
  中国食品药品检定研究院; 武汉生物制品研究所有限责任公司