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摘要
目的 DHRS4是细胞内NADP(H)依赖性视黄醇脱氢/还原酶家族成员4的编码基因。与人类DHRS4基因以头对头形式存在的反义转录本AS1DHRS4,可以调控DHRS4基因的转录。本研究高通量检测分析DHRS4反义RNA结合的蛋白以探讨DHRS4反义转录本调控正义基因表达的作用机制。方法采用甲醛交联细胞内的核酸-蛋白复合物,然后通过生物素标记的奇数组和偶数组寡核苷酸作为探针pull-down AS1DHRS4结合的蛋白,LCMS/MS鉴定后数据库比对分析DHRS4反义RNA结合的蛋白。结果奇数组和偶数组探针pull-down后分别鉴定得到650种和508种蛋白,两组探针检测的共同蛋白434种。大部分蛋白为结合蛋白并与RNA的加工和修饰相关。结论 DHRS4反义RNA结合的蛋白的检测和分析为今后进一步研究反义RNA功能和机制提供了线索和基础。
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