BEND6过表达对小鼠神经干细胞基因转录表达的影响

作者：周梦杰; 孙倩倩; 于洋^*

来源：基础医学与临床, 2023, 43(02): 246-251.

DOI：10.16352/j.issn.1001-6325.2023.02.246

• BEN结构域
• BEND6蛋白
• 神经干细胞

目的 探究在小鼠神经干细胞(NSCs)中过表达BEND6对其基因转录表达的影响，分析BEND6在小鼠神经发育过程中潜在的生物学功能。方法 在贴壁培养的小鼠NSCs中分别瞬时转染pCMV-mScarlet(对照组)和pCMV-mScarlet-BEND6(实验组)质粒，24 h后在显微镜下观察细胞中红色荧光的表达以确认mScarlet和mScarlet-BEND6蛋白的表达。分别提取两组细胞的总RNA,通过全转录组二代测序并对测序数据进行质控、参考基因组比对、定量分析、差异基因表达分析和富集分析，从而表征BEND6过表达对小鼠NSCs基因转录表达的影响及其在小鼠神经发育中的潜在功能。结果 成功获取并贴壁培养小鼠NSCs。全转录组测序分析发现，与对照组相比，过表达BEND6的神经干细胞中有165个差异表达基因，其中有102个基因上调，63个基因下调。富集分析显示这些差异表达基因主要与膜电位改变，突触传递，刺激反应，生长发育等生物学过程的调节有关。结论 BEND6过表达能够调控小鼠NSCs中的特定基因的转录水平，可能具有调控特定生物学过程及小鼠生长发育的功能。

• 单位
  北京协和医学院; 中国医学科学院基础医学研究所