基因测序技术是当前生物技术的核心所在,其检测方法迅速发展,目前正处于从二代测序向三代测序的过渡转变期。纳米孔(Nanopore)检测技术是近年来出现的较大规模、迅速发展的检测技术,该技术有效避免了传统二代测序技术短片段拼接和仪器笨重等弊端,代之以非扩增方式测序、实验周期短、携带方便等优势更适于现场快速检测。本综述围绕纳米孔测序技术的原理、检测方法、技术特点及其在病原体检测中的应用进行介绍,并探讨了其发展前景。