中国汉族人群热休克蛋白60基因多态性及连锁不平衡分析

作者：王静; 江琪; 杨晓波; 何美安; 白云; 何越峰; 邬堂春

来源：卫生研究, 2009, (03): 332-335.

• 汉族
• 热休克蛋白
• 基因多态性
• 连锁不平衡
• 单倍型

目的分析中国汉族人群热休克蛋白60(HSP60)基因多态性及连锁不平衡关系。方法采用分片断扩增直接测序的方法,结合Taqman探针基因分型技术对30名无关健康汉族志愿者进行HSP60基因多态性检测和单倍型分析。结果(1)共检出13个频率大于1%的HSP60单核苷酸多态性(SNPs)位点,其中4个为新发现SNPs。9个已报道的SNPs分别为rs1116734、rs3749095、rs1050347、rs8539、rs2340690、rs3214832和rs7585486,内含子7无rs编号的(a/c),rs788016;4个新SNPs分别是:位于2号染色体198189061a/g,198184890a/g,198184774ag/--,198180643ac/--(内含子7),杂合度分别为0.06、0.04、0.5和0.5。(2)SNPs:rs1116734、rs1050347、rs8539、rs2340690、和rs788016在不同人种中的分布差异均有显著性(P=0.00)。(3)连锁不平衡分析(LD)后发现rs1116734与198189061a/g,rs1116734与rs788016不存在连锁不平衡。rs1050347、rs2340690、rs3214832、rs7585486及198180659a/c(无rs编号)两两间完全连锁不平衡,rs8539、198184774ag/--、198180643ac/-两两间完全连锁不平衡。以R2大小及最小等位基因频率对13个SNPs进行选择,5个代表性SNPs位点rs1116734、rs3749095、rs8539、rs2340690、和rs788016均可构成9种单倍型。结论中国汉族人群HSP60的SNPs分布有别于其他人种,rs1116734、rs3749095、rs1050347、rs8539、rs2340690、rs3214832、198184774ag/-、rs7585486、198180659a/c、198180643ac/-、rs788016是HSP60基因在中国汉族人群中较常见的SNPs。rs1116734、rs3749095、rs8539、rs2340690和rs788016是5个较有代表性的SNPs。

• 单位
  公共卫生学院; 华中科技大学同济医学院; 郧阳医学院