当前我国科研经费管理存在的问题很多,包括过度行政化导致科研经费分配不合理、立法缺失造成科研经费使用风险不确定、责任界定不明致使科研经费监管不到位等,因此有必要借鉴国外"负面清单"制度和国内上海自贸试验区的"负面清单"探索经验,在完善经费申报、审批、使用、监管配套制度的基础之上,制订出一份科学合理的科研经费"负面清单"。文章认为,只有通过加强科研经费使用"事中"和"事后"监管,消除科研经费使用的诸多隐性壁垒,才能真正促进科研事业的长远发展。