基于数值分析的常微分方程参数估计方法计算量大,近年来提出的两步估计虽然计算量小,但参数估计的方差难以得到。有效的方差估计应建立在准确的参数估计的基础之上。文章针对基于光滑核函数的两步估计,从中选择最优窗宽,以优化参数估计,在准确的参数估计基础上,提出了用boostrap法估计由两步估计得到的参数的方差。最后利用模拟数据,选择出最优窗宽,并在此基础上验证了这种参数的方差估计方法是有效的。