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摘要
目的:初步探讨丙型肝炎病毒6 a型感染的状态。方法:对经HCV 5′非编码区(5′NCR)复合酶切分型结果为6 a的3例样本(95,126,150)进行5′NCR和NS5B区的扩增、测序,然后将5′NCR和NS5B区序列与24个HCV全基因参考序列(均来自GenBank)比对并构建遗传进化树。结果:对3例分型结果为6 a型的样品进行5′NCR序列分析发现,这3例样品都具有6 a型特征性的第-145位的CA碱基插入,且与6 a型参考序列Y12083的同源性最高,分别为0.993,0.987,0.993;进化树分析表明,3例样本都属于6 a型。然而NS5B区的序列分析结果表明,95,126,150在NS5B区与1b型参考序列HC-J4的同源性最高,分别为0.934,0.930,0.926;进化树分析结果也显示它们都属于1b型,两个区的分型结果完全不同。为排除引物扩增效率的问题,使用6 a型特异的引物对3例样品进行NS5B区扩增,3例样本扩增结果均为阴性。结论:我们发现的HCV 6 a型的感染中,存在3例样品5′NCR和NS5B区的分型结果不一致,尚无直接证据证明其是否发生了基因重组。但是,我们的结果提示,在两个或两个以上区域进行HCV分型是非常重要的,且HCV基因型之间的重组必须纳入到HCV分型的考虑中来。
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