水稻Epagri108铁毒胁迫条件下表达谱芯片数据分析

作者：刘慰华; 寇姝燕; 吴志刚; 崔永祯; 朱振华; 袁平荣

来源：分子植物育种, 2021, 19(20): 6624-6628.

DOI：10.13271/j.mpb.019.006624

• 铁毒胁迫
• 基因芯片
• 差异表达基因

铁是水稻必需的微量营养元素之一,但是土壤中积累过量亚铁盐会对水稻造成毒害作用。本研究通过生物信息学方法挖掘水稻Affymetrix表达谱芯片的数据,研究水稻种质Epagri108在铁毒胁迫处理和对照条件下的基因差异表达情况。结果显示,筛选到差异倍数在2倍及以上的基因407个,以对照处理组作为参照,铁毒胁迫条件下上调基因330个,下调基因77个。Gene Ontology和信号通路分析结果表明,这些差异表达基因主要涉及氧化还原反应、糖代谢、氨基酸代谢等生物学过程。本研究通过挖掘这些数据,初步探讨水稻在铁毒胁迫处理条件下的基因表达模式,为进一步揭示水稻耐受铁毒胁迫相关的分子机制提供了科学依据。

• 单位
  云南省农业科学院粮食作物研究所