山羊TSPAN6基因克隆及序列分析

作者：陈欣欣; 崔羽茜; 王宁; 任玉鹏; 张焕容; 杨发龙; 朱江江; 向华^*

来源：中国畜牧杂志, 2023, 59(10): 133-139.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20221124-04

• 山羊
• TSPAN6基因
• 基因克隆
• 生物信息学分析

TSPAN6是四跨膜蛋白超家族成员之一，与病毒毒力、致病性及肿瘤发生相关。本研究旨在克隆山羊TSPAN6基因序列并进行生物信息学分析。以简州大耳羊为实验对象，无菌采集其肝脏，Trizol法提取组织总RNA，并反转录为cDNA,RT-PCR技术克隆山羊TSPAN6基因序列，利用在线软件进行生物信息学分析。结果显示，成功克隆得到TSPAN6基因，共1 400 bp(GenBank登录号：ON337134)，包括5’UTR 149 bp,CDS区长738bp,3’UTR23bp，编码245个氨基酸残基。山羊TSPAN6基因序列与绵羊、牛、猪、斑马、海豹和狐狸的相似性分别达到99.32%、98.24%、93.63%、93.90%、92.41%和92.68%。TSPAN6蛋白分子式为C1259H1952N310O346S18，分子质量为27 544.30 Da，是1种偏碱性、稳定的疏水性蛋白。TSPAN6蛋白无信号肽，存在4个跨膜结构域，二级结构显示以α螺旋为主，无β折叠结构，含有1个N糖基化位点与41个磷酸化位点。亚细胞定位预测TSPAN6蛋白主要定位于细胞膜，可能与MAVS、ZFHX4、SEZ6L2等10个蛋白存在相互作用。本实验成功克隆了山羊TSPAN6基因，为后续山羊TSPAN6基因功能的研究提供了参考依据。

• 单位
  西南民族大学