山羊DNMT3B和KHDRBS2多态性及其与繁殖性能关联分析

作者:李昆谕; 刘玉芳; 陶林; 江炎庭; 欧阳依娜; 储明星*; 洪琼花*
来源:特产研究, 2022, 44(04): 1-7.
DOI:10.16720/j.cnki.tcyj.2022.018

摘要

本研究旨在分析DNMT3B和KHDRBS2单核苷酸多态性(SNPs)与山羊繁殖性状的关联。通过MassARRAY SNP分型技术对DNMT3B和KHDRBS2 SNPs位点进行分型,检测其在云上黑山羊(n=544)、济宁青山羊(n=133)和辽宁绒山羊(n=91)3个群体中的遗传学特征,并将其多态性与繁殖性能(产羔数、初生窝重和断奶窝重)进行关联分析。群体遗传学分析表明,DNMT3B g.61480806G>A位点在云上黑山羊中为中度多态(0.25T在云上黑山羊、济宁青山羊和辽宁绒山羊中均为低度多态(PIC<0.25);卡方适合性检验表明,DNMT3B g. 61480806G>A和g.61491787C>T两个位点在云上黑山羊、济宁青山羊和辽宁绒山羊中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。KHDRBS2g.48441364C>T位点在3种山羊中均为中度多态(0.25T、g.48441325T>C和g.48610246G>C位点在3种山羊中均为低度多态(PIC<0.25);卡方检验表明,KHDRBS2 g.48610246G>C位点在3个群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);KHDRBS2 g.47872502C>T、g.48441325T>C和g.48441364C>T 3个位点在云上黑山羊中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。关联分析结果表明,DNMT3B g.61491787C>T位点TC型的初生窝重和断奶窝重显著高于TT型(P<0.05);KHDRBS2 g.47872502C>T位点CC型的产羔数显著高于CT型(P<0.05),g.48441364C>T位点CC型产羔数显著高于CT型和TT型(P<0.05)。综上所述,DNMT3B g.61491787C>T位点或可作为筛选云上黑山羊初生窝重和断奶窝重的潜在分子标记,KHDRBS2 g.47872502C>T和g.48441364C>T位点或可作为云上黑山羊产羔数选择的潜在分子标记。

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