基于肠道病毒A71型基因组研究其毒力相关位点

作者：李洁; 杜轶威; 霍达; 杨扬; 梁志超; 贾蕾; 陈丽娟; 王全意

来源：中华实验和临床病毒学杂志, 2018, 32(03): 318-322.

• 肠道病毒A71型
• 基因组
• 毒力

目的基于肠道病毒A71型(EV-A71)基因组探索研究其毒力相关位点。方法计算来源于轻症、死亡病例的EV-A71各段基因的遗传距离,分析基因同源性;对轻症、死亡病例来源的EV-A71的5’UTR区核苷酸、结构蛋白编码区和非结构蛋白编码区氨基酸进行比对,分析与EV-A71毒力相关的位点。结果来源于轻症和死亡病例的2株EV-A71均属C4a基因型,基因组同源性为96.2%97.5%、5’UTR的第ⅴ结构域核苷酸相同,结构一致;结合从Gen Bank上下载的C4a型EVA71的全基因组序列开展分析,结果显示在EV-A71蛋白编码区共发现4个氨基酸位点与病毒毒力相关,是潜在毒力位点,分别为非结构蛋白编码区的2 A区R68M、2C区K41R、3 A区T/V47A及3C区I158V。结论死亡病例和轻症病例来源的EV-A71非结构蛋白编码区部分氨基酸位点的变异可能与病毒毒力相关。

• 单位
  北京市疾病预防控制中心; 北京市预防医学研究中心