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摘要
黄枝油杉是中国特有的珍稀濒危树种，具有较高的生态、经济和科研价值。本研究基于转录组测序结果对黄枝油杉进行EST-SSR标记开发，使用MISA软件对黄枝油杉132 191条Unigenes进行SSR搜索，共获得6 903个SSR位点，出现频率为5.22%，平均12.015 kb出现一个SSR位点。SSR重复类型以单核苷酸重复为主，二核苷酸重复和三核苷酸重复次之，所占比例分别55.15%、17.14%、17.07%。采用SSR分子标记筛选出225对扩增清晰且符合预期片段大小的引物，有效扩增率为69.23%，经复筛最终获得9对具有多态性SSR引物。对1个野生黄枝油杉种群25个样品进行多样性检测，所有位点均具有多态性。在9对多态性SSR位点中，等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、Shannon’s指数（I）、观测杂合度（Ho）、期望杂合度（He）、多态信息含量（PIC）分别为5.111、2.668、0.963、0.456、0.461、0.428。结果表明，9对SSR引物遗传多样性处于中等水平，基于黄枝油杉转录组序列的SSR标记开发是可行有效的，为开展黄枝油杉遗传多样性分析及辅助育种等研究提供参考。
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